Temperaturen siger ikke noget direkte om forurening, men enzymer i levende dyr og planter virker hurtigere ved høje temperaturer og det betyder, at mange processer går langt hurtigere i varmt vand. fx vil organisk stof nedbrydes hurtigere, og derfor vil iltforbruget også ske hurtigere.
Iltkrævende fisk som ørreder holder sig væk fra varmt vand. Dels fordi det indeholder mindre ilt, men også fordi fisken forbrænder maden hurtigere i det varme vand, og på den måde kan komme til at sulte.
Vandløb der løbe i skygge for træer, vil ofte have lavere temperatur, og helt unge vandløb der er grundvandsfødte, har en konstant temperatur på 8 grader.